Nhiều bộ gen của các loại tảo xanh (diệp lục) đã được giải mã (ví dụ như Chlamydomonas, Micromonas hay Ostreicoccus) trong khi bộ gen của tảo lục Chlorella - với tiềm năng kinh tế lớn nhất nhờ ứng dụng làm thức bổ sung - đến nay vẫn chưa được thực hiện.

Phân tích bộ gen của tảo lục Chlorella cho thấy có 9791 gen protein, bằng tổng số lượng gen của tảo Micromonas. Những thông tin di truyền này giúp hợp lý hóa việc sử dụng tảo lục Chlorella trong nhiều ứng dụng công nghiệp khác nhau. Việc đối chiếu phân tích với các bộ gen của nhiều loại tảo xanh khác nhau hiện nay cũng giúp phác thảo được chân dung di truyền của loài tảo tổ tiên chung của chúng. Ở tảo thủy tổ dường như đã tập trung được phần lớn đặc điểm sinh học tổng hợp các kích thích tố cần thiết cho sinh trưởng và phát triển thực vật trên cạn.

Bất ngờ hơn cả, việc giải mã bộ gen tảo Chlorella còn phát hiện một số lượng gen tương đối chi phối hoạt động tổng hợp protein lông roi. Điều này cho thấy trước đó tảo lục Chlorella có thể đã hình thành một chu kỳ giới tính mà đến nay vẫn chưa được khám phá ra. Ngoài ra, khả năng tổng hợp kitin của tảo lục Chlorella cũng rất có khả năng được thừa hưởng từ một loài virus - bản thân virus này cũng có enzym kitinaza để đảm bảo độc quyền ký sinh vật chủ của nó so với các loài khác không có khả năng đục xuyên vỏ. Cơ chế "độc quyền" này là minh chứng cho một phương thức cùng tiến hóa mới giữa virus và vật chủ.